大腸菌ディスプレイ法

大腸菌ディスプレイ法とは?

・抗体のディスプレイ法は大規模なライブラリのスクリーニングにとって必須の技術です。

・ファージ、リボソーム、酵母、大腸菌等のディスプレイ系が知られています。

・大腸菌ディスプレイはシンプルかつスピーディーな点が優れており、抗体の表面提示量が多いという特徴があります。

MACS, FACSを用いて、効率的な陽性クローンの選抜が可能です。

・大腸菌へのディスプレイには、Lpp-OmpA, Autotransporter(AIDA-I, Intimin)等、様々な外膜タンパク質が利用されています。これら 

   の外膜タンパク質に抗体断片を融合させ、大腸菌表面へ抗体をディスプレイします。バイオピークでは、IntiminscFv抗体・  

   VHH抗体・VNAR抗体の大腸菌表面ディスプレイに利用しています。

・大腸菌へIntiminを用いたディスプレイにより、抗体の表面提示量が飛躍的にが増加するため、パニングに磁性ビーズを使用する

 ことが可能になります。磁性ビーズの利用により濃縮の工程が簡便に短時間に行うことが可能です。

 

Intiminによる抗体の大腸菌ディスプレイ

Intiminは腸管病原性大腸菌の持つ膜タンパク質であり、大腸菌ディスプレイにおいて、他の外膜タンパク質に比べて低毒性であり、優れた提示能力を示しています。Intimin β-BarrelC末端に抗体を配置することで、scFv抗体・VHH抗体・VNAR抗体を大腸菌表面に提示します。大腸菌表面には104-5程度の抗体の発現が報告されており、この提示量はファージやリボソームにく比べると圧倒的に多く、陽性クローンの取りこぼしが無く、短時間にライブラリーを濃縮できます。

 

大腸菌ディスプレイ法によるスクリーニング

スクリーニング手順

 

1.  外膜タンパク質 IntiminC端に抗体(scFvVHHVNAR)を融合させ、    

    ライブラリーを作製

 

 

 

 

2.  抗体を発現誘導した大腸菌、すなわち大腸菌の外膜表面にディスプレイ

     されている抗体とビオチン標識抗体を反応させる。

 

 

 

 

 

3.  抗ビオチン抗体標識磁気ビーズと反応させる。

 

 

 

 

4.  磁性カラムを用いて、磁気ビーズを介して抗原と結合している抗体を

  発現してる大腸菌を濃縮

 

 

 

 

5.  磁気ビーズと結合しない大腸菌の洗浄・除去

 

 

 

 

 

 6. 磁気カラムから磁気ビーズと結合している大腸菌を溶出し、回収

 

 

 


大腸菌ディスプレイ法の問題点と解決

ディスプレイ法には大きなライブラリを扱える最大の利点があり、存在確率の低いレアクローンの取得の可能性が向上します。

しかし、ディスプレイ法のみで抗原と結合する抗体発現クローンを所得しようとする場合、多大な労力と長い時間を必要となる

問題があり、クローンの同定は困難です。

例えば、109のライブラリーを105規模まで濃縮することは得意ですが、その後、個々の陽性クローンを同定するのは、繰り返しの作業に必要な労力と長い時間が必要です。さらに、繰り返しのパニングによりクローンに偏りが発生してしまう問題も知られて

います。バイオピークではこれらの問題を解決するため、抗体の提示系である大腸菌ディスプレイ法と抗体の分泌系である抗体

ダイレクトクローニング法を組み合わせるスクリーニング法を開発しました。大腸菌ディスプレイ法は繰り返し作業を行わないため短時間に大規模なライブラリーから陽性クローンを濃縮し、続いて行う抗体ダイレクトクローニングで濃縮した陽性クローンの

クローニングと同定を3日間で行うことが可能になりました。